Além dos recursos do tesouro estadual destinados ao Fundo Paraná, as parcerias com o Ministério da Ciência e Tecnologia - MCT/Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico – CNPq e a Secretaria de Estado da Ciência, Tecnologia e Ensino Superior - SETI/Fundação Araucária têm proporcionado um significativo incremento de recursos para o desenvolvimento científico e tecnológico do Estado. Novas edições de programas atualmente em execução deverão ser lançadas no decorrer deste ano e em 2009, conforme tratativas realizadas na reunião do Conselho Nacional das Fundações Estaduais de Amparo à Pesquisa (CONFAP), nesta quinta-feira (03/07) na sede do CNPq, e também nos dias 26 e 27 de junho.
Além do programa de Iniciação Científica Junior, com recursos já programados até 2010, a Fundação Aracária deverá firmar novos termos de cooperação com o CNPq para novas edições do Programa Primeiros Projetos – PPP, Desenvolvimento Científico Regional – DCR e o Programa de Apoio a Núcleos de Excelência – Pronex. Os recursos para os programas mencionadas serão da ordem de R$ 9 milhões, sendo R$ 6 milhões do CNPq - que representa 30% do orçamento anual da Fundação Araucária - e R$ 3 milhões da Fundação Araucária.